El año 2001 se constituye una alianza estratégica entre la Universidad del Desarrollo y Clínica Alemana de Santiago, con el objetivo de crear la Facultad de Medicina, que hoy alberga a ocho carreras en la sede Santiago y cuenta con especialidades médicas y odontológicas, subespecialidades y centros de investigación, cuyo trabajo ha obtenido diversos reconocimientos a nivel nacional e internacional.
La vocación de emprendimiento y la responsabilidad pública, así como la adhesión a la conducta ética y el apego al trabajo bien hecho fueron los ejes de la naciente Facultad de Medicina Clínica Alemana Universidad del Desarrollo.
En 2002, la Facultad abre sus puertas y recibe a su primera promoción de estudiantes en las carreras de Medicina y Enfermería.
Además, para respaldar la base científica y ética de los alumnos, se crean centros/institutos de investigación orientados a las áreas de: Ciencias, Bioética, Epidemiología y Políticas de Salud, Genética Humana, Neurociencias y Salud Mental
Tres años más tarde ingresó la primera generación de Odontología; mientras que el 2007 lo hicieron los alumnos de Nutrición y Dietética, Tecnología Médica, Kinesiología y Fonoaudiología.
El 2009 se inauguró el edificio de la Clínica Odontológica UDD, en la comuna de La Florida, principal campo clínico de la carrera de Odontología y que además cuenta con instalaciones para actividades docentes asistenciales de las carreras de Kinesiología, Fonoaudiología, Nutrición y Dietética, y Psicología.
En 2019 ingresó la primera generación de la carrera de Obstetricia.